プログラミング研究職にやってほしいプログラミングの勉強法【SIGNATE, kaggle】
Masu こんにちは、製薬研究者のMasuです。 今回は、研究職の方に是非やってほしいプログラミングの勉強法についてまとめていきます。 機械学習の勉強法に関しては、以前以下の記事で紹介し...
バイオインフォマティクス
プログラミング
研究者用記事【TargetMine】特定のタンパク質に関連する疾患を調べる
Masu こんにちは、製薬企業で研究職として働くMasuです。 TargetMineは創薬支援を行うウェブツールです。誰でも無料で利用することができます。 30以上の公共データベースを利用し、疾...
プログラミング【webスクレイピング】Uniprotのタンパク質情報を超効率的に集めてみる
マイクロアレイやプロテオミクスなどから得た大量のタンパク質リストがあるとき、各遺伝子の機能や局在データを一つ一つ手作業で集めることは困難です。割り切って探すのも一つの手ですが、pythonを使うと超効率的に情報収集ができます。
研究者用記事Uniprotでタンパク質・遺伝子情報を調べる①【概要編】
遺伝子やタンパク質に関係する研究を行うときは、uniprotは欠かせません。ここではuniprotの基本的な使い方について解説していきます。
研究者用記事DAVIDで始めるKEGG pathway解析！
pathway解析をしたいときは、DAVIDというサイトが非常に便利です。初心者向けに分かりやすく、DAVIDの使い方を解説していきます。